根據原國內貿易部《商業特許經營辦法(暫行)》第十四規定，特許者向被特許者收取下列費用：
第一、加盟金，即特許者在將特許經營權授予被特許者時所收取的一定的費用。如某特許經營合同規定：“本合同訂立前，乙方必須向甲方一次性繳納特許經營加盟金五萬元。
第二、特許權使用費，即被特許者在使用特許經營權的過程中按一定的標準或比例向特許者定期支付的費用。根據一九九七年財政部《企業連鎖經營有關財務管理問題的暫行規定》第十六條的規定，加盟店根據合同，按不高于銷售額3%的比例支付各特許者的與其生產經營有關的特許權使用費，計入管理費用。如某特許經營合同規定：“在合同有效期內，乙方應按特許企業總營業收入的3%按月向甲方繳納特許經營權使用費”，“自特許企業開業之日起，乙方應在每月結束的五日內，將該月的特許經營權使用費匯至甲方指定賬戶”。
第三、 保證金，即為確保被特許者履行特許經營合同，特許者可要求被特許者交付一定的保證金，合同到期后保證金應退還被特許者。保證金可以促使被特許者忠實履行合同。如被特許者違約，特許人可用保證金充抵特許經營權使用費和違約金。如某特許經營合同規定：“本合同訂立前，乙方應向甲方繳納十萬元保證金，合同期滿后甲方將保證金退還乙方，若乙方拖延繳納特許經營權使用費，甲方有權用保證金充抵。乙方收到充抵通知后，必須在五日內將保證金補足。若乙方不能按期補足保證金，甲方有權終止合同并不再退還保證金”。
第四、其他費用即特許者根據特許經營合同為被特許者提供相關服務-并收取的相應費用。如特許人派出專業技術管理人員的費用、廣告費的分攤、店面設計費、專項指導服務費、委托代理費等等。這部分費用通常在特許經營合同之外單獨約定。
實踐中，特許者可收取上述費用的一種或幾種，具體金額可根據實際情況進行約定。
