連鎖經營企業存貨的管理包括采購、入庫儲存、發貨等環節。為了保護存貨的安全、完整，確保會計信息的準確可靠，降低存貨成本，提高經營效率，必須以職責分工為基礎所設計實施對存貨管理進行制約和協調的一種內部管理制度。
1、 采購業務的管理
(1)、職能分工控制
連鎖經營企業應將存貨采購業務交由專門部門負責，建立采購業務崗位責任制，明確采購工作任務和工作程序，以及工作責任。要防止因職責不清，出現錯弊不易查找的情況發生。
(2)、授權批準控制
銷售部門提出要貨計劃，包括需貨的品名、規格、數量、需貨時間經部門負責人批準后，交由采購部門編制采購計劃，經主管領導人批準采購計劃書后，由采購部門落實進行采購。采購人員必須按經領導批準的采購清單采購，無論從數量和品種、規格和單價都無權擅自決定。若因市場原因需要修改采購清單時，必須經主管領導人員批準或授權。
(3)、采購合同控制
存貨采購應盡量與供應商簽訂訂購合同，以保證按期、按量、按質購入存貨，以滿足企業生產經營業務的需要。采購合同應經企業法人或法人授權人簽發生效。
(4)、建立詢價制度
由于市場供需價格千變萬化，要有專門業務部門或人員負責存貨價格、供需要求等調研、詢價工作，以控制成本、降低風險。
2、 存貨入庫、儲存的管理
企業訂購的存貨送達后，要經質檢部門和有關業務部門根據存貨的商品運單、發票、采購合同以及產品生產廠家提供的質檢單、出庫單、說明書加以審查驗收，若發現其他問題，則按所簽訂的合同，由企業有關部門和人員去處理和解決。
所購商品等存貨經質檢部門審查后驗收入庫，倉庫保管員應依據入庫單核對實物，查明其規格、數量，是否與入庫單相一致，并簽字認可，以建立保管責任制，防止丟失、毀損、變質，以保證存貨的安全。
存放商品的倉庫要做到：(1)、創造安全條件 倉庫應具有防盜、防火、防潮等具體措施。(2)、規范存放秩序與位置 如分區保管、定位存放、五五成行、快速記數等。
3、 存貨發出業務的管理
存貨發出要有授權批準制度，倉庫保管員憑手續齊全并有主管領導、送貨人簽字認可的發貨單發貨。
存貨管理建議使用POS系統(銷售時點系統)。POS系統對每種商品實時購銷存狀態隨時記錄，管理者可通過該系統及時正確地監控業務經營，并做出各種采購及庫存決策。進行存貨管理的部門是商品配送中心。
